به گزارش پایگاه خبری آستان حضرت معصومه سلام‌الله علیها، آیت‌الله سید محمد سعیدی تولیت آستان مقدس بانوی کرامت با صدور پیامی درگذشت حجت‌الاسلام والمسلمین سید ابراهیم میرباقری را به برادر وی، حجت‌الاسلام والمسلمین سید مهدی میرباقری تسلیت گفت که متن این پیام به شرح زیر است:

بسم الله الرحمن الرحیم
إِذَا مَاتَ الْعَالِمُ ثُلِمَ فِي الْإِسْلَامِ ثُلْمَةٌ لَا يَسُدُّهَا شَيْءٌ إِلَى يَوْمِ الْقِيَامَةِ.
دانشمند فرزانه جناب حجت الاسلام و المسلمین سید مهدی میر باقری دامت توفیقاته
خبردرگذشت برادربزرگوارتان عالم جلیل القدرسلاله السادات حجت الاسلام والمسلمین سید ابراهیم میرباقری رحمه الله علیه موجب تالم وتاسف فراوان گردید
سال ها مجاهدت علمی،فرهنگی واجتماعی و ترویج وتبلیغ فرهنگ حیات بخش قرآن و مکتب اهل بیت علیهم السلام وپرورش و تربیت شاگردان بسیارازجمله خدمات ارزشمند وحسنات آن عالم وارسته واستاد سطوح عالی حوزه علمیه می باشد .
درجواربارگاه ملکوتی حضرت فاطمه معصومه علیهاالسلام رحلت این عالم بزرگواررا به جنابعالی وخاندان مکرم میرباقری ،دیگربازماندگان و همه علاقه مندان تسلیت گفته و ازدرگاه الهی برای شما صبرجمیل واجرجزیل و برای آن مرحوم علو درجات ،غفران و رحمت واسعه مسئلت میکنم